PBJ | 中国农科院基因组所张春芝课题组解析马铃薯彩色薯肉形成的分子机制
花青素是一类广泛分布的黄酮类次生代谢物,不仅是植物色彩的重要决定因素,还作为抗氧化剂参与植物对生物和非生物胁迫的响应。此外,富含花青素的食物对人类健康具有多种益处。马铃薯(Solanum tuberosum L.)作为一种重要的块茎类作物,起源于安第斯山脉的地
花青素是一类广泛分布的黄酮类次生代谢物,不仅是植物色彩的重要决定因素,还作为抗氧化剂参与植物对生物和非生物胁迫的响应。此外,富含花青素的食物对人类健康具有多种益处。马铃薯(Solanum tuberosum L.)作为一种重要的块茎类作物,起源于安第斯山脉的地
得益于高通量测序技术的发展,宏基因组测序已成为揭示各种环境中微生物功能和物种组成的有力工具。在宏基因组分析的标准流程中,首先将测序获得的大量短读取(reads)组装成较长的重叠群(contigs)并预测编码基因;而计算基因的丰度通常基于使用Bowtie 2、S
近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队和茄科蔬菜育种创新团队,构建了野生和栽培辣椒高质量基因组,解析了辣椒的染色体核型、基因组三维结构与基因表达调控元件的演化特征,发现了转座子驱动的结构变异和高频渐渗事件对辣椒重要性状形成的重要贡献。……(
在基因组学的研究中,结构变异(Structural Variants, SVs)一直是一个备受关注却又充满挑战的领域。与常见的单核苷酸变异(Single Nucleotide Variants, SNVs)和小型插入缺失变异(indels)相比,SVs的研究面
近日,中国农业大学动物科技学院张毅课题组在国际出版集团Wiley旗下知名学术期刊《前沿科学》(Advanced Science)在线发表了题为《完整基因组景观揭示亚洲水牛隐藏的进化历史和选择信号》(Complete Genomic Landscape Reve
膀胱癌是泌尿系统中常见的恶性肿瘤,其发生与环境暴露和生活方式密切相关。吸烟被公认为膀胱癌的主要风险因素之一,其中烟草中的多环芳烃类前致癌物(如苯并芘,BaP)通过代谢活化可诱发基因突变。然而,不同组织暴露于这些化合物后所表现的基因组突变模式存在显著差异,具体的
肝细胞癌(HCC)作为全球癌症领域的棘手难题,不仅位列六大常见癌症之一,更是导致癌症死亡的第三大元凶。尽管在早期筛查和病毒性肝炎管理方面我们取得了长足进步,但晚期HCC患者的预后依然堪忧。日本东京大学Masao Omata教授等在2024年12月20日出版的H
马克斯普朗克生物物理研究所和海德堡大学的研究人员发现了HIV如何进入人类细胞核。人类免疫细胞(如巨噬细胞)的核孔中聚集并通过装有病原体遗传物质的锥形蛋白囊。衣壳的圆锥形似乎有利于通过孔的运输,因为胶囊的通过会产生一种力,使核孔的环破裂。这一发现可能有助于开发新
在生物学研究中,“生命之树”——即描绘地球上所有物种进化关系的系统发育树,一直是理解生物多样性和进化历程的核心框架。构建准确的物种树对于比较基因组学、进化生物学、保护生物学等领域都至关重要。然而,随着测序技术的飞速发展,我们积累了海量的基因组数据,传统的物种树
在生命科学领域,构建准确的物种进化树始终是解码生命演化奥秘的核心任务。随着测序技术的飞速发展,研究者们正面临一个幸福的烦恼——如何处理海量的全基因组数据?传统方法如同用显微镜观察星空,虽能捕捉局部细节,却难以拼凑完整的进化图景。CASTER的横空出世,彻底改变
脓毒性脊柱感染的病因学诊断对精准抗生素治疗至关重要。传统的检测方法通常较慢且效果不佳。近年来,宏基因组下一代测序(mNGS)在病原检测方面取得了革命性进展,为疾病管理提供了更有效的途径。本研究采用多中心回顾性观察性研究方法,将mNGS与微生物培养进行比较,全面
1月20日,记者从中国热带农业科学院(以下简称“中国热科院”)获悉,该院品资所花卉中心三角梅团队联合中国农业科学院深圳基因组所、澳大利亚Murdoch大学、海南大湖桥园林、海南大信园林等多家单位,在Scientific Data期刊上发表了题为“Chromos
多倍体植物基因组中,不同染色体组之间的差异被认为是植物适应环境、进化历史和性状形成的重要驱动力。然而,传统的基因组分析方法将所有染色体组“拼接”成一个参考基因组,忽略了这些关键的基因组间和组内变异。随着泛基因组学技术的飞速发展,尤其是利用泛基因组的构建和分析实
2024年12月18日,上海辰山植物园联合福建农林大学、中国科学院武汉植物园、中国科学院分子植物科学卓越创新中心、丹麦哥本哈根大学和马达加斯加塔那那利佛大学等多家研究机构在Molecular Plant上发表题为Genomic, transcriptomic
为促进我国细胞生物学领域研究人员的交流与合作,推动中国细胞生物学学科的发展,“中国细胞生物学学会2025年全国学术大会·珠海”将于2025年4月7-11日在广东省珠海市举行。细胞世界近期将推送最新分会场介绍,敬请关注。
DNA作为遗传信息的载体,其序列和功能的保守性一直是研究的热点。然而,与此相对的是,位于染色体着丝粒(centromere)及其周边区域的卫星DNA(satellite DNA)展现了惊人的演化速度,其快速变化的序列和丰度令人困惑。尽管卫星DNA在细胞分裂中具
在那儿,我会指着模样奇特的鲟鱼,神秘兮兮地跟他讲:“这种鱼可有两亿多年的历史咯,和你超爱的恐龙那可是同一个时代的‘老朋友’!”虽说随着孩子慢慢长大,看我的眼神里时不时多了几分嫌弃,但我可没忽悠他,这千真万确是事实。
1月8日,中国农业大学动物科学技术学院李孟华教授团队在国际知名学术期刊《自然·遗传》(Nature Genetics)发表论文《绵羊T2T基因组组装鉴定与毛用性状相关的变异》(Telomere-to-telomere sheep genome assembly
兰科(Orchidaceae)是被子植物中最大且最具多样性的科之一,其中石斛属(Dendrobium Sw.) 作为兰科的三大属之一,约包含1800个物种。石斛兰通常以附生或岩生方式生长,具有粗壮的气生根、发达的假鳞茎以及形态各异、变化丰富的双侧对称花朵。由于
natureplants 基因组 石斛属 2025-01-10 19:12 23
RyboDyn是一家专注于开发针对暗基因组的免疫疗法的公司,旨在训练免疫系统在内部检测和根除癌症。近日,该公司宣布获得400万美元种子轮融资,由SeaX Ventures和Genedant Capital联合领投,SOS Ventures和Swell VC参投